SMP Muhammadiyah 1 Mlati Sleman, membahas program Kelas Khusus Olahraga (KKO) yang baru berjalan sekitar satu tahun. Program ini merupakan bentuk pengembangan olahraga pendidikan yang bertujuan mewadahi siswa berbakat di bidang olahraga sekaligus tetap menjaga prestasi akademik dan keagamaan mereka.